Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms