Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms