Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPDC1A2A3K4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPDC1A2A3K4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms