Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

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Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD7Q9P2D1 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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