Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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