Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTGFRP43088 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTGFRP43088 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTGFRP43088 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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