Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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