Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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EFNB3Q15768 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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EFNB3Q15768 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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EFNB3Q15768 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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EFNB3Q15768 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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EFNB3Q15768 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
EFNB3Q15768 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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