Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ARID4AP29374 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms