Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00266-4P-202ENST00000611754 723 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C20orf197-201ENST00000625080 2732 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF596-203ENST00000398612 2863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 STPG1-203ENST00000374409 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CERS3-201ENST00000284382 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL136982.1-201ENST00000444431 4560 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02023-201ENST00000472120 1948 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC8A1-201ENST00000332839 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF860-201ENST00000360311 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EFCAB6-201ENST00000262726 4869 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MCTP2-203ENST00000451018 2472 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 THNSL2-201ENST00000324166 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DDX53-201ENST00000327968 3629 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL356273.3-201ENST00000623474 1989 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms