Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEPT4-211ENST00000579371 1362 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ABCA9-207ENST00000495634 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IFT46-201ENST00000264020 1819 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR1296-201ENST00000408136 92 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC245100.4-203ENST00000635493 1357 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR4P4-202ENST00000641760 2086 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR1269A-201ENST00000408636 105 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms