Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC002451.2-201ENST00000624998 2398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 LOXHD1-211ENST00000579038 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AC024600.1-201ENST00000425902 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 L3MBTL4-AS1-201ENST00000578427 2044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRHP20396 AC073133.2-201ENST00000436670 2698 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 ERVMER34-1-201ENST00000440542 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRHP20396 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRHP20396 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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TRHP20396 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 AL354984.1-201ENST00000371169 1854 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 OR11A1-203ENST00000377149 2611 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 CLEC4M-205ENST00000394122 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 FANCF-201ENST00000327470 4269 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRHP20396 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC079612.1-201ENST00000358775 3700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 AL160290.1-201ENST00000415509 416 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRHP20396 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TRHP20396 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TRHP20396 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRHP20396 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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