Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP39Q53GS9 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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