Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL008626.1-201ENST00000412357 775 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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