Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREM-213ENST00000374734 711 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRBOX1-201ENST00000383748 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX470209.1-201ENST00000421297 916 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf74-202ENST00000426997 879 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002381.1-201ENST00000439829 615 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL541P-201ENST00000464317 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024451.3-201ENST00000517810 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161725.1-211ENST00000592805 889 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX649601.1-201ENST00000608264 572 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD1P1-201ENST00000576210 1327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355312.2-201ENST00000455607 1541 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSR1-203ENST00000355282 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL8P1-201ENST00000428182 611 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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