Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms