Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AP000436.1-201ENST00000605239 800 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC002094.5-201ENST00000623773 629 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC145625.1-201ENST00000441444 592 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DQB1P01920 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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