Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms