Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PPARGC1AQ9UBK2 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PPARGC1AQ9UBK2 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PPARGC1AQ9UBK2 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PPARGC1AQ9UBK2 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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