Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms