Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
COG3Q96JB2 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
COG3Q96JB2 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms