Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms