Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
AP3M2P53677 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms