Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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