Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 POLR2D-201ENST00000272645 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 C10orf126-202ENST00000614533 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC084876.2-201ENST00000624844 1709 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC025580.2-204ENST00000560077 2399 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 PGAM1P9-201ENST00000503887 755 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AL807752.5-201ENST00000569497 820 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC006130.1-201ENST00000589365 555 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RN7SL536P-201ENST00000612366 290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CD200R1L-205ENST00000617549 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RN7SL545P-201ENST00000620547 290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RN7SL759P-201ENST00000620768 290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC011389.3-201ENST00000623273 999 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 C20orf78-202ENST00000623418 606 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ALOXE3-202ENST00000380149 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 DCTN4-202ENST00000446090 1737 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CENPL-201ENST00000345664 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 C2orf42-201ENST00000264434 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 NAA16-201ENST00000379406 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 ADGRE3-202ENST00000344373 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 PPP1R14D-201ENST00000299174 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ZBED2Q9BTP6 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms