Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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