Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms