Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ETFBKMT-203ENST00000412352 1083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXD12P35452 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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