Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
APOBEC3GQ9HC16 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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