Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBE3AQ05086 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms