Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3M2P53677 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms