Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLIC4Q9Y696 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms