Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KPTNQ9Y664 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KPTNQ9Y664 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms