Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAB39Q9Y376 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAB39Q9Y376 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms