Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YBX2Q9Y2T7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YBX2Q9Y2T7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms