Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNEQ9Y223 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms