Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNQ9UQP3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms