Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms