Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH4Q9UQ05 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH4Q9UQ05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms