Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF9BQ9UPX0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9BQ9UPX0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms