Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZRN3Q9UPQ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms