Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IQSEC3Q9UPP2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IQSEC3Q9UPP2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms