Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRQQ9UMZ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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