Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms