Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNMA3Q9UL41 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNMA3Q9UL41 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms