Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC9Q9UKV0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC9Q9UKV0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms