Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms