Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCNL1Q9UK58 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNL1Q9UK58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNL1Q9UK58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms