Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00527Q9UJ94 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00527Q9UJ94 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms