Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNA3Q9UI47 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms